流化床锅炉运行中消耗的生物质燃料，当然燃料也要合乎一些条件才可以，如果其质量不达标或者规格不同的话，会直接造成 流化床锅炉的运行受到不良影响。除了它给料要合格之外，它的清洗系统也要设计合理。
作为它的燃料，要掺混均匀，不均匀的话容易出现层状堆积，导致直线螺旋给料机进料时无法掺混均匀，出现单一燃料进入料仓，影响它的正常运转。
还有关于其燃料的水分，不能大于设计规定范围，避免造成燃料黏结，堆积密度增加，空隙率减少，在料仓堆积压实，形成堆积墙，产生蓬料，主要是单一螺旋不能运行时比较明显。
另外，燃料内长纤维所占比例以及燃料的颗粒度大小，都会影响着它的运行，要么因燃料黏结产生团状连接，形成料塞，要么因燃料颗粒而增加堆积密度越大，产生蓬料和堵料。
其清洗系统的设计也有很多讲究，比如说临时管道内不得有砂石和其他杂物，水平敷设的临时管道朝排水方向的倾斜度不得小于1/200。其清洗泵入口应加装小于5mm的滤网，且水箱水位应高于泵入口至少2m，目的是为了不出现气蚀。